>Tengo una tabla vfp 6 que convierto a excel, pero necesito modificar el encabezado desde fox, hay algo que se pueda hacer?

Si te refieres solo a cambiar los nombres de los campos puedes crear un cursor primero y luego copiar el resultado a excel. Algo como:

Select campo1 As Nombre, campo2 As Apellido From miTabla Into Cursor TempNombres
Copy To miExport.xls Type XL5

Para mayor control sobre la apariencia la automatizacion de Excel que menciona Alex se hace necesaria.