Realmente no es tan dificil.
Yo tuve el mismo problema, y para resolverlo, modifique GENDBC la utileria que viene con VFP para reconstruir
las bases de datos.
El metodo es el siguiente:
- Ejecutas GENDBC y cuando te pregunte el nombre del PRG de indicas: ODBCDEF
- Ya que tienes generado ODBCDEF.PRG que te crea la base de datos, lo debes incluir en tu proyecto.
- Cada vez que creas una empresa, ejecutas la siguiente funcion: GENDBC("X:\RUTA\DE\LA\EMPRESA")
- En el PATH lo estableces a la ruta de datos.

Eso te permite que si distribuyes en CD o algun otro medio tus aplicaciones, se pueda generar la base de datos

El GENDBC que yo modifique esta disponible en la seccion de downloads del UT, creo que es GENDBC_M o algo asi


Mauricio