Olá Cleber,

Como o Hilmar disse, você pode usar RELEASE e CLEAR para liberar as variáveis.

Esteja atento, entretando, para o fato de que uma vez que as variáveis existem na memória, não há uma forma de diferenciar qual tem escopo público ou local. Sendo assim, se as suas variáveis obedecem um padrão de nomenclatura que estabebeça um prefixo para as que são públicas ("g" por exemplo), você poderia usar o comando RELEASE ALL com a cláusula LIKE. Veja o exemplo:

PUBLIC gcVar1
PUBLIC gcVar2
LOCAL lcVar1
LOCAL lcVar2

RELEASE ALL LIKE g*

Um abraço!