Olá Pedro!

Como o Hilmar falou, guarde suas tabelas antigas em um diretório à parte como, por exemplo, C:\Temp. E tente o seguinte:

If File("C:\Temp\Tab1.dbf")
   Use Tab1   && Abra a nova tabela
   Use C:\Temp\Tab1 Alias TabTemp In 0   && Tabela antiga
   Append From TabTemp
   
   Use In TabTemp
   Use In Tab1
Endif

Outra maneira e que talvez seja melhor de se fazer é utilizar a função Adir() e com isto pegar todas as tabelas antigas e depois através dela abrir as novas e aplicar o append from.

lnQtdArq = Adir(laArq, "C:\Temp\*.dbf")
For I = 1 To lnQtdArq
   Use (laArq(1, 1)) Alias TabN && Abre a tabela nova
   lcTabVelha = "C:\Temp\" + laArq(1, 1)
   Use (lcTabVelha) Alias TabV In 0
   Append From TabV

   Use In TabV
   Use In TabN
Endif

Espero que isto o ajude.
Até mais.