Hola!
Existe por si acaso algun software tan practico como Installshield para hacer actualizaciones de softwares donde los clientes.

Este debe de cumplir con las siguientes especificaciones:
1- Que actualize los ejecutables que le indique.
2- Que registre nuevas .dlls y activex.
3- Que actualize bases de datos y tablas sin afectar su contenido,
etc.