SELECT "TablaB"
APPEND FROM <RutaTablaA>

Dices que tienes 50 folios de A en B?, quizás convendría mejor borrarlos todos y dejar que el APPEND FROM se lleve todos los de A a B.
De otro modo tambien puedes crear un cursor con SELECT - SQL en el cual solo tengas los registros que deseas pasar a la otra tabla y hacer (otra vez) el APPEND FROM:

SELECT * FROM TablaA where <Condicion> INTO CURSOR cFiltrados
SELECT "TABLAB"
APPEND FROM DBF("cFiltrados")

Espero te haya servido de ayuda.

>Tengo 2 tablas con el mismo nombre pero en diferente directorio, en una (A) tengo toda la informacion 3000 registros y en la otra (B) tengo solamente 50 de ellos con su folio, De que manera rapida puedo actualizar B con los datos de A sin recurir al comando REPLACE y poner todos sus campos?

>Tengo la idea de que es con el APPEND FROM, pero como quedaria la instruccion considerando que las 2 tablas son iguales y su indice es el campo Folio?

>Todo esto es porque quiero hacer una opcion de envio de informacion (solo de ciertos folios) de archivos o actualizacion del programa que esta en otro directorio.